EL MURO DE LAS LAGRIMAS, localizado cerca de Puerto Villamil se puede llegar en carro o arrendar bicicletas. Es un sitio histórico porque entre 1946 y 1959 existió una colonia penal, durante esta época, para castigar a los presos, se les obligó a construir un muro que alcanzo 100 metros de largo por 7 metros de altura y mas de 3 metros de ancho con bloques de lava. Se puede subir unas escalinatas y tener una vista panoramica del lugar. Cerca se puede apreciar las bases de concreto donde los norteamericanos tenian sus casas de madera durante la segunda guerra mundial.

En el camino al Muro de las Lágrimas, hay varios sitios turísticos para conocer. Los Humededales es una zona de pozas de agua salobre con gran variedad de aves, El Estero es un rincón tranquilo para conocer los manglares, El Túnel del Estero fue formado por erupciones volcánicas y desemboca en el mar, se puede ingresar unos metros cuando la marea esta baja, La Playa del Amor, una laguna de agua de mar de poca profundidad y muy cerca a la costa rocosa donde suelen descansar las iguanas marinas.

A unos sesenta minutos de Puerto Villamil en bote se llega a la zona llamada Los Túneles. Esta serie de túneles se formadon hace mucho tiempo mediante gigantescas erupciones con enormes flujos de lava que al llegar al mar se enfriaron rápidamente.

A muy corta distancia de Puerto Villamil se encuentra el islote de Las Tintoreras llamado así por la existencia de una grieta de lava con agua tranquila y transparente donde suelen descansar los tiburones de aleta de punta blanca, llamadas tintoreras. Se puede practicar buceo de superficie en un sector señalizado para esta actividad además de observar pinguinos y otras aves.

Una corta caminata desde el centro de Puerto Villamil pasando por varias pozas o en carro se llega al centro de crianza de tortugas. Aquí se pueden observar tortugas de todas las edades y conocer el proceso de crianza y recuperación en cautiverio. Las tortugas gigantes son emblema de las Islas Galápagos y la Isla Isabela es la única con 5 sub-especies diferentes.

A muy corta distancia de Puerto Villamil cerca del muelle de arribo de pasajeros se encuentra un sendero corto para llegar a Concha de Perla. Durante el camino se puede observar los 4 tipos de manglares que existen. Concha de Perla es una bahía de poca profundidad de agua tranquila y transparente ideal para buceo de superficie para ver a lobos marinos y tortugas marinas.